Los problemas de Fisker comenzaron con un retiro de su batería por parte del proveedor A123 Systems en diciembre de 2011, seguido de un segundo retiro en marzo de 2012 y, finalmente, la quiebra de A123 Systems en agosto de 2012. Además de detener la producción durante más de cinco meses, sin fecha anunciada para su reanudación, la producción planificada del segundo modelo, el Fisker Atlantic, se pospuso, junto con el cese del desarrollo del nuevo modelo.

En febrero de 2012, Tom LaSorda fue nombrado nuevo director ejecutivo, y Henrik Fisker se convirtió en presidente ejecutivo,  pero seis meses después, el 14 de agosto, La Sorda fue reemplazado por Tony Posawatz , anteriormente director de la línea de vehículos de General Motors para el Chevrolet Volt . 

La compañía sufrió un revés el 29 de octubre de 2012, cuando el huracán Sandy inundó y destruyó todo su cargamento europeo de 338 Karmas en Port Newark, Nueva Jersey . Dieciséis de los coches se quemaron, porque entre seis y ocho pies de agua de mar provocaron un cortocircuito en la unidad de control del vehículo en un Karma, y ​​los fuertes vientos propagaron el incendio resultante a otros 15. La compañía afirmó que su batería de iones de litio no era la culpable. La aseguradora XL Insurance America inicialmente negó la reclamación por pérdidas de aproximadamente US$30 millones y posteriormente fue demandada por Fisker en la Corte Suprema del Estado de Nueva York. El caso se resolvió mediante un acuerdo extrajudicial no revelado.

Henrik Fisker dimitió en marzo de 2013 [ 28 ] tras desacuerdos con la dirección, en particular sobre la estrategia empresarial. Poco después de la salida de Henrik Fisker de Fisker Automotive, el 5 de abril de 2013, Fisker despidió al 75 % de su plantilla, conservando únicamente a un grupo básico de 40 trabajadores mientras continuaba las negociaciones con posibles inversores.

El 11 de octubre de 2013, Hybrid Technology LLC acordó comprar el préstamo gubernamental en mora de Fisker con un gran descuento. El 22 de noviembre de 2013, Fisker presentó su caso de bancarrota del Capítulo 11. Simultáneamente, el 23 de noviembre de 2013, Fisker acordó, sujeto a la aprobación del tribunal de bancarrota, ser adquirida por Hybrid, propiedad del multimillonario de Hong Kong, Richard Li. En el último momento, sin embargo, el proveedor de piezas chino Wanxiang Group presentó una oferta competitiva de US$ 24,75 millones, apoyada por el Comité Oficial de Acreedores en el caso. Wanxiang había perdido anteriormente frente a Hybrid en la licitación para la compra del préstamo del gobierno a Fisker. Wanxiang es propietario de A123 Systems LLC, el antiguo proveedor de baterías de Fisker, y Fisker argumentó que la conducta de Wanxiang fue en parte responsable del fracaso comercial de Fisker. Como parte de su oferta, Wanxiang propuso reiniciar la producción del Karma.

Wanxiang recibió la aprobación judicial el 18 de febrero de 2014 para comprar los activos de Fisker después de una subasta de tres días contra Hybrid con una oferta de $149.2 millones, con una oferta inicial de $55 millones, significativamente más que la oferta anterior de $24.75 millones, y significativamente más alta que los $25 millones que Hybrid Technology LLC pagó al Departamento de Energía por un pagaré de $164 millones. Además de los $25 millones, el DOE también recuperó $28 millones de Fisker para un total de $53 millones recuperados de su préstamo de $192 millones. 

Tras la subasta de quiebra estructurada de Fisker Automotive en febrero de 2014, Henrik Fisker conservó el logotipo y las marcas registradas de Fisker. Posteriormente, el Grupo Wanxiang transformó los activos de Fisker Automotive en una nueva empresa llamada Karma Automotive , lanzando así el coche híbrido enchufable Karma Revero , basado en el Fisker Karma. Posteriormente, Henrik Fisker fundó otra empresa de vehículos eléctricos llamada Fisker Inc. en 2016, con el logotipo y las marcas registradas de Fisker.